En la mujer: Deficiencias hormonales, irregularidad de los ciclos menstruales y ovulos de mala calidad son las razones internas más comúnes en la mujer, y todas son tratables por la medicina de hoy. Hay causas relacionadas con la anatomía femenina: útero congénitamente anormal, fibromas en el úteero, quistes en el ovario, endometriosis que bloquea el acceso de los espermatozoides a las trompas de Falopio y que con ello evita que se implante el óvulo fecundado, infecciones del sistema reproductivo, clamidiosis, adherencias congénitas o por cirugías. Algunos problemas inmunológicos impiden la fecundación: anticuerpos que destruyen espermatozoides o atacan al embrión en la primera fase. Infertilidad temporal luego de una prolongada rutina de control de la natalidad.
En el hombre: Los más comúnes, el conteo bajo de espermatozoides, la motilidad pobre de los mismos espermatozoides, falta de producción de esperma, incapacidad de los espermatozoides de fecundar el óvulo. Causas relacionadas con la anatomía masculina bloqueo en el vaso deferente por causas congénitas o por infecciones o la vasectomía. Anticuerpos que evitan que el espermatozoide fecunde el óvulo.
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